廣東省科學院微生物研究所(原廣東省微生物研究所)前身為中科院中南真菌研究室，於1964年5月19日經國家科委批準成立，1972年改為廣東省微生物研究所，隸屬於廣東省科學院，2021年1月更名為廣東省科學院微生物研究所。依托研究所，廣東省微生物分析檢測中心於1999年經廣東省編辦批準成立。作為具有熱帶亞熱帶區域特色與優勢的微生物學專業科研機構，廣東省科學院微生物研究所麵向國家和廣東省社會經濟發展對微生物學的重大需求，長期重點致力於具有熱帶亞熱帶特色的微生物資源、微生物與生態環境、食品安全及健康等相關基礎、應用基礎及公益性研究，開展為支撐生物技術相關行業可持續發展的共性關鍵技術研究及儲備性前沿技術探索;形成了資源微生物學、環境微生物學、分析微生物學和黴腐微生物學等四大國內優勢學科，具備碩、博士研究生培養能力，擁有博士後科研工作站。

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